fix: remove hardcoded paths from MCP server and documentation

docs/claude-code-integration.md

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-# Claude Code x LEANN 集成指南
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-## ✅ 现状：已经可以工作！
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-好消息：LEANN CLI已经完全可以在Claude Code中使用，无需任何修改！
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-## 🚀 立即开始
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-### 1. 激活环境
-```bash
-# 在LEANN项目目录下
-source .venv/bin/activate.fish  # fish shell
-# 或
-source .venv/bin/activate       # bash shell
-```
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-### 2. 基本命令
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-#### 查看现有索引
-```bash
-leann list
-```
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-#### 搜索文档
-```bash
-leann search my-docs "machine learning" --recompute-embeddings
-```
-
-#### 问答对话
-```bash
-echo "What is machine learning?" | leann ask my-docs --llm ollama --model qwen3:8b --recompute-embeddings
-```
-
-#### 构建新索引
-```bash
-leann build project-docs --docs ./src --recompute-embeddings
-```
-
-## 💡 Claude Code 使用技巧
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-### 在Claude Code中直接使用
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-1. **激活环境**：
-   ```bash
-   cd /Users/andyl/Projects/LEANN-RAG
-   source .venv/bin/activate.fish
-   ```
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-2. **搜索代码库**：
-   ```bash
-   leann search my-docs "authentication patterns" --recompute-embeddings --top-k 10
-   ```
-
-3. **智能问答**：
-   ```bash
-   echo "How does the authentication system work?" | leann ask my-docs --llm ollama --model qwen3:8b --recompute-embeddings
-   ```
-
-### 批量操作示例
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-```bash
-# 构建项目文档索引
-leann build project-docs --docs ./docs --force
-
-# 搜索多个关键词
-leann search project-docs "API authentication" --recompute-embeddings
-leann search project-docs "database schema" --recompute-embeddings
-leann search project-docs "deployment guide" --recompute-embeddings
-
-# 问答模式
-echo "What are the API endpoints?" | leann ask project-docs --recompute-embeddings
-```
-
-## 🎯 Claude 可以立即执行的工作流
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-### 代码分析工作流
-```bash
-# 1. 构建代码库索引
-leann build codebase --docs ./src --backend hnsw --recompute-embeddings
-
-# 2. 分析架构
-echo "What is the overall architecture?" | leann ask codebase --recompute-embeddings
-
-# 3. 查找特定功能
-leann search codebase "user authentication" --recompute-embeddings --top-k 5
-
-# 4. 理解实现细节
-echo "How is user authentication implemented?" | leann ask codebase --recompute-embeddings
-```
-
-### 文档理解工作流
-```bash
-# 1. 索引项目文档
-leann build docs --docs ./docs --recompute-embeddings
-
-# 2. 快速查找信息
-leann search docs "installation requirements" --recompute-embeddings
-
-# 3. 获取详细说明
-echo "What are the system requirements?" | leann ask docs --recompute-embeddings
-```
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-## ⚠️ 重要提示
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-1. **必须使用 `--recompute-embeddings`** - 这是关键参数，不加会报错
-2. **需要先激活虚拟环境** - 确保有LEANN的Python环境
-3. **Ollama需要预先安装** - ask功能需要本地LLM
-
-## 🔥 立即可用的Claude提示词
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-```
-Help me analyze this codebase using LEANN:
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-1. First, activate the environment:
-   cd /Users/andyl/Projects/LEANN-RAG && source .venv/bin/activate.fish
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-2. Build an index of the source code:
-   leann build codebase --docs ./src --recompute-embeddings
-
-3. Search for authentication patterns:
-   leann search codebase "authentication middleware" --recompute-embeddings --top-k 10
-
-4. Ask about the authentication system:
-   echo "How does user authentication work in this codebase?" | leann ask codebase --recompute-embeddings
-
-Please execute these commands and help me understand the code structure.
-```
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-## 📈 下一步改进计划
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-虽然现在已经可以用，但还可以进一步优化：
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-1. **简化命令** - 默认启用recompute-embeddings
-2. **配置文件** - 避免重复输入参数
-3. **状态管理** - 自动检测环境和索引
-4. **输出格式** - 更适合Claude解析的格式
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-但这些都是锦上添花，现在就能用起来！
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-## 🎉 总结
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-**LEANN现在就可以在Claude Code中完美工作！**
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-- ✅ 搜索功能正常
-- ✅ RAG问答功能正常
-- ✅ 索引构建功能正常
-- ✅ 支持多种数据源
-- ✅ 支持本地LLM
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-只需要记住加上 `--recompute-embeddings` 参数就行！